数据集概述
本数据集包含dI1单细胞RNA测序（scRNAseq）相关的分析数据与代码，涵盖对照分析、差异分析及腹侧迁移分析等内容，为Rekler等人2025年的研究提供支持，适用于相关生物学机制的深入探究。
文件详解
该数据集由多个目录和文件组成，具体说明如下：
- 根目录文件：
- LOC list.xlsx：Excel格式文件，可能包含位置列表相关数据
- List of Probes.xlsx：Excel格式文件，可能包含探针列表信息
- Control analysis/目录：
- dI1 clusters markers for dotplots.xlsx：Excel格式文件，dI1聚类标记点图数据
- trajectory_dI1_control.xlsx：Excel格式文件，dI1对照轨迹分析数据
- Control Functional Pathways.xlsx：Excel格式文件，对照功能通路分析数据
- Control-RARa403 Differential Analysis/目录：
- DE_dI1_diff_trajectory_seurat.xlsx：Excel格式文件，基于Seurat的dI1差异轨迹分析数据
- Control-RARa403 Functional Categories.xlsx：Excel格式文件，对照与RARa403差异功能分类数据
- Ventral Migration Analysis/目录（含E5、E6子目录）：
- 多个R代码文件（.r格式）：如1- convert_to XY.R、2- Normalize to NT size.R、3- dI1 density plots.R等，用于数据转换、标准化、密度图绘制等分析步骤
- 多个Excel数据文件（.xlsx格式）：如NT size.xlsx、153_analysis (RAW DATA).xlsx、154_dI1_analysis (RAW DATA).xlsx等，包含原始数据及分析结果数据
适用场景
- 生物学研究：分析dI1细胞的基因表达、功能通路及迁移机制
- 差异分析：探究Control与RARa403条件下dI1细胞的差异表达及轨迹变化
- 迁移分析：研究dI1细胞在不同发育阶段（E5、E6）的腹侧迁移特征
- 数据复现：复现Rekler等人2025年研究中的分析结果与图表
