数据集概述
该数据集围绕分段RNA噬菌体(如φ6及其亲缘株)的基因重配率展开,通过实验进化操纵病毒颗粒电泳迁移率作为表型标记,结合全基因组测序和杂交实验,验证不同地理来源分离株的重配率差异,为病毒进化研究提供数据支持。
文件详解
该数据集包含11个文件,分为文档类和数据类,具体说明如下:
- 文档类文件(.txt、.pdf格式):
- README_for_phenotypic_mixing_experiment.txt、README.txt:数据集说明文档,包含数据用途、联系方式及内容解释
- schematic_of_selection_for_electrophoretic_mobility.pdf:电泳迁移率选择实验示意图
- Table2_phenotypic_mixing.txt:表2相关分析代码及说明,涉及ggplot2和mixtools工具依赖
- Figure2_genbank_numbers_genome_sequencing.txt:图2相关的基因组测序GenBank编号信息
- calculation_of_Rf_values.pdf:Rf值计算方法说明文档
- mobility_of_crosses.txt:杂交迁移率数据相关文本文件
- Figure4_single_plaques.txt:图4相关的单噬菌斑数据说明
- 数据类文件(.csv格式):
- single_plaques_from_single_burst.csv:单爆发单噬菌斑数据,字段包括Rf(相对迁移率)、Count(计数)、Name(样本名)、Replicate(重复次数)、Date(日期)
- mobility_of_crosses.csv:杂交迁移率数据,字段包括Rf、Count、Name、Replicate
- phenotypic_mixing_experiment.csv:表型混合实验数据(具体字段未完全展示)
适用场景
- 病毒进化研究:分析不同地理来源分段RNA噬菌体的基因重配率差异及其进化机制
- 分子病毒学研究:探究电泳迁移率作为病毒表型标记的应用价值
- 微生物生态学研究:揭示环境因素对病毒基因交换行为的影响
- 进化生物学研究:验证病毒有性繁殖与地理隔离的关联机制