电泳迁移率验证分段RNA噬菌体地理分离株重配偏倚数据集

数据集概述

该数据集围绕分段RNA噬菌体(如φ6及其亲缘株)的基因重配率展开,通过实验进化操纵病毒颗粒电泳迁移率作为表型标记,结合全基因组测序和杂交实验,验证不同地理来源分离株的重配率差异,为病毒进化研究提供数据支持。

文件详解

该数据集包含11个文件,分为文档类和数据类,具体说明如下: - 文档类文件(.txt、.pdf格式): - README_for_phenotypic_mixing_experiment.txt、README.txt:数据集说明文档,包含数据用途、联系方式及内容解释 - schematic_of_selection_for_electrophoretic_mobility.pdf:电泳迁移率选择实验示意图 - Table2_phenotypic_mixing.txt:表2相关分析代码及说明,涉及ggplot2和mixtools工具依赖 - Figure2_genbank_numbers_genome_sequencing.txt:图2相关的基因组测序GenBank编号信息 - calculation_of_Rf_values.pdf:Rf值计算方法说明文档 - mobility_of_crosses.txt:杂交迁移率数据相关文本文件 - Figure4_single_plaques.txt:图4相关的单噬菌斑数据说明 - 数据类文件(.csv格式): - single_plaques_from_single_burst.csv:单爆发单噬菌斑数据,字段包括Rf(相对迁移率)、Count(计数)、Name(样本名)、Replicate(重复次数)、Date(日期) - mobility_of_crosses.csv:杂交迁移率数据,字段包括Rf、Count、Name、Replicate - phenotypic_mixing_experiment.csv:表型混合实验数据(具体字段未完全展示)

适用场景

  • 病毒进化研究:分析不同地理来源分段RNA噬菌体的基因重配率差异及其进化机制
  • 分子病毒学研究:探究电泳迁移率作为病毒表型标记的应用价值
  • 微生物生态学研究:揭示环境因素对病毒基因交换行为的影响
  • 进化生物学研究:验证病毒有性繁殖与地理隔离的关联机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.35 MiB
最后更新 2025年12月20日
创建于 2025年12月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。