数据集概述
本数据集来自Apc1638N小鼠模型实验,对比饮食(高脂喂养)与遗传(Leprdb/db突变)诱导肥胖对肠道微生物组和代谢组的影响,包含肠道肿瘤量化、粪便微生物OTU表及代谢物数据,用于探究肥胖与结直肠癌的关联机制。
文件详解
- OTU table.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含OTU(操作分类单元)ID及对应样本的丰度数据,涉及古菌(Archaea)等微生物类群的丰度记录
- Stool metabolites.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录粪便中代谢物的种类及丰度数据,包含饮食与遗传诱导肥胖组差异代谢物及共有的5种代谢物(如腺苷)信息
- Meta and tumor data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含小鼠实验的元数据(如肥胖诱导方式)及肠道肿瘤量化数据,涉及肿瘤数量、炎性因子(Il1b、Tnf)表达量等关联指标
数据来源
论文“Diet- and genetically-induced obesity differentially affect the fecal microbiome and metabolome in Apc1638N mice”
适用场景
- 肥胖与结直肠癌关联机制研究: 分析饮食/遗传肥胖对肠道微生物组、代谢组的影响及与肿瘤发生的关系
- 肠道微生物组代谢组差异分析: 对比不同肥胖诱导方式下微生物类群(如Firmicutes、Proteobacteria)和代谢物的变化特征
- 抗炎微生物与代谢物功能研究: 探究Parabecteroides distasonis、腺苷等抗炎因子在肿瘤发生中的作用
- 生物标志物筛选: 识别与肥胖及肠道肿瘤相关的微生物或代谢物生物标志物