数据集概述
本数据集包含复现群体水平RNA-seq差异表达分析方法评估结果所需的R代码和数据,对应针对Genome Biology 2022年论文的相关通信研究,聚焦半合成RNA-seq数据模拟中标准化影响的分析,涉及FDR和Power结果的复现。
文件详解
- 文件名称:
Correspondence_LiEtAl_GenomeBiology_ExageratedFDR.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含复现研究结果所需的R代码文件及相关数据文件,具体字段需解压后查看代码与数据的对应关系,核心支持FDR(错误发现率)和Power(检验效能)结果的计算与验证。
数据来源
通信文章“Neglecting normalization impact in semi-synthetic RNA-seq data simulation generates artificial false positives”(针对论文“Exaggerated false positives by popular differential expression methods when analyzing human population samples, Genome Biology 23, 79, 2022”)
适用场景
- RNA-seq差异表达分析方法评估: 用于验证不同差异表达分析方法在群体水平RNA-seq数据中的FDR和Power表现。
- 生物信息学方法复现研究: 支持相关通信研究结果的重复验证,确保分析方法的可靠性。
- 半合成RNA-seq数据模拟优化: 分析标准化处理对模拟数据结果的影响,优化数据模拟流程。
- 群体水平转录组数据分析: 为群体样本RNA-seq数据的差异表达研究提供方法选择参考。