数据集概述
本数据集围绕大薯(Dioscorea alata L.)的染色体进化及农艺性状遗传基础展开,包含基于非洲育种群体的高密度遗传图谱、数量性状位点(QTL)定位数据,涉及炭疽病抗性及块茎品质等关键农艺性状,为大薯遗传育种提供基因组学工具与分析资源,共含19个文件。
文件详解
- CSV数据文件(共13个)
- 文件名称:包括TDa1419_1610.csv、TDa1610.csv、TDa1403.csv、TDa1506.csv、TDa1419.csv、TDa1621.csv、TDa1512_1603.csv、TDa1401B.csv等
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含大薯育种材料的遗传标记数据,部分文件含DY编号(如DY17-2486、DY18-2634)等样本标识信息
- Excel数据文件(共6个)
- 文件名称:QTL_interval_annotations.xlsx、QTL_phenotypes_tuber_traits.xlsx、QTL_phenotypes_YAD_DLA.xlsx等
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:QTL区间注释文件含数量性状位点的基因组注释信息;块茎性状表型文件含块茎品质相关性状数据;YAD_DLA表型文件含炭疽病抗性等农艺性状表型数据
数据来源
论文“Chromosome evolution and the genetic basis of agronomically important traits in greater yam”
适用场景
- 大薯染色体进化研究: 分析大薯基因组的古异源四倍体化事件及基因组重组模式
- 农艺性状遗传定位: 定位大薯炭疽病抗性、块茎品质等关键农艺性状的数量性状位点
- 作物分子育种应用: 利用遗传标记与QTL数据开发大薯分子标记辅助选择工具
- 育种群体遗传分析: 解析大薯育种群体的近交程度与种间渐渗区域特征
- orphan作物基因组资源拓展: 完善大薯作为orphan作物的基因组学研究基础数据