地衣共生体相互作用与光生物多样性研究数据集

数据集概述

本数据集围绕地衣共生体相互作用展开,分析了2356条藻类ITS序列,涉及梅衣科等真菌属及培养的小球藻菌株,探究真菌对藻类的特异性与选择性,以及生态地理分布对共生关系的影响,包含序列比对、系统发育分析及补充数据。

文件详解

  • 序列比对与系统发育文件(.nex格式):
  • ITS_clade_I_21May2015_Final.nex、ITS_COX_rbcL_psbJ_21May2015v1.nex、ITS_alignment_21May2015_Final.nex、ITS_clade_A_21May2015_Final.nex、ITS_clade_S_21May2015_Final.nex、ITS_clade_G_21May2015_Final.nex:包含藻类ITS及叶绿体、线粒体基因的序列比对数据,用于系统发育分析。
  • 补充表格文件(.xlsx格式):
  • Supp_Table_S1.xlsx:可能包含实验样本信息、OTU分类数据或统计结果。
  • 序列文件(.fasta格式):
  • Supp_Text_T1_v1.fasta:包含代表性序列数据,用于OTU验证及命名。
  • 文档文件(.pdf格式):
  • tables2_4_figsS1_S7.pdf:包含研究中的表格、图表及补充说明。

适用场景

  • 地衣共生关系研究:分析真菌对藻类的特异性与选择性机制。
  • 光生物多样性分析:探究小球藻属未描述多样性及地理分布模式。
  • 生态地理学研究:评估生态地理因素对地衣共生组合的影响。
  • 系统发育分析:基于多基因序列开展藻类分类与进化研究。
  • 微生物生态学:探索共生微生物间的相互作用及群落构建机制。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 6.03 MiB
最后更新 2025年12月12日
创建于 2025年12月12日
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