数据集概述
本数据集记录福尔马林固定淡水鱼类标本的DNA提取质量与数量指标，对比两种提取方案（含/不含缓冲液洗涤预处理的热碱消化法）在三种鱼类（南方溪七鳃鳗、粘杜父鱼、褐鳟）中的效果，分析提取方案、组织类型（肌肉/尾鳍）、保存时长对DNA浓度、纯度及片段长度的影响，包含Excel数据表与说明文档。
文件详解
- README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：提供数据集背景、数据描述与文件结构说明，解释DNA提取实验设计、质量评估指标定义及数据分析方法。
- DNA_extraction_DATA.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：含3个工作表（对应3个鱼类物种），记录DNA数量（Qubit 3.0测定）、A260/A280纯度比值、A260/A230纯度比值、≥300bp片段占比（ImageJ测定）等指标，以及提取方案、组织类型、保存时长等分组信息。
数据来源
论文“Unlocking the genomes of formalin-fixed freshwater fish specimens: An assessment of factors influencing DNA extraction quantity and quality”
适用场景
- 分子生物学方法优化：分析不同预处理方案对福尔马林固定标本DNA提取质量的影响，优化提取流程。
- 鱼类基因组研究：为福尔马林固定淡水鱼类标本的基因组分析提供DNA质量评估参考。
- 标本保存策略制定：探究保存时长对DNA完整性的影响，指导生物标本长期保存方案。
- 组织类型提取差异研究：对比肌肉与尾鳍组织的DNA提取效果，筛选鱼类标本最优取样部位。
