数据集概述
本数据集通过DNA宏条形码技术分析美国密歇根州10个种群的东部侏响尾蛇(濒危物种)食性,包含83份粪便样本的测序结果及分析代码。识别出至少12种猎物,以小型哺乳动物为主,幼蛇与成蛇食性存在差异,为该物种保护策略制定提供依据。
文件详解
- QIIME2_bioinformatic_code.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含QIIME2生物信息学分析流程代码,用于处理食性DNA测序数据,涉及序列处理、分类单元识别等分析步骤
- emr-qiime-metadata.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:QIIME2分析所需的元数据文件,记录样本相关信息(如种群、样本编号等),用于关联测序数据与样本背景
- README.MD.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、数据采集方法、文件说明等内容
数据来源
论文“Diet of a threatened rattlesnake (eastern massasauga) revealed by DNA metabarcoding”
适用场景
- 濒危爬行动物食性研究: 分析东部侏响尾蛇的猎物组成、食性偏好及年龄差异,为物种保护提供生态依据
- DNA宏条形码技术应用: 验证该技术在爬行动物非侵入性食性分析中的有效性与准确性
- 保护策略制定: 基于食性数据指导东部侏响尾蛇栖息地管理与猎物资源保护
- 生物信息学流程参考: 参考QIIME2分析代码,优化其他爬行动物食性DNA数据的分析流程