数据集概述
本数据集是论文“Enhancing DNA metabarcoding for biomonitoring with phylogenetic estimation of OTUs' ecological profiles”的补充数据，包含139个样本的测序数据、形态学计数数据及样本位点信息，用于支持基于系统发育估计OTU生态特征的DNA宏条形码生物监测研究。
文件详解
- 278 (139 x 2 replicates) samples fastq files.rar
- 文件格式：RAR
- 内容说明：包含测序平台提供的278个fastq文件，对应139个样本的2个测序重复（A和B），文件为已拆分和拼接的DNA reads
- Counts_diatoms.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容说明：包含139个样本的形态学清单，含物种列表（Omnidia代码）和瓣膜丰度数据
- Sites_list.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容说明：包含139个样本的位点信息，包括河流名称、GPS坐标、分子分析使用的代码（与测序fastq文件名对应）
数据来源
论文“Enhancing DNA metabarcoding for biomonitoring with phylogenetic estimation of OTUs' ecological profiles”（提交至Molecular Ecology Resources期刊）
适用场景
- DNA宏条形码生物监测优化研究：用于分析基于系统发育估计OTU生态特征对生物监测准确性的提升效果
- 淡水硅藻群落分析：通过形态学计数数据与分子测序数据的关联，研究硅藻群落结构与环境的关系
- 样本位点信息整合：结合河流名称、GPS坐标等位点信息，开展生物地理分布与环境因子的相关性分析
- 测序重复数据验证：利用双重复测序数据评估DNA宏条形码分析的重复性与稳定性
