数据集概述
本数据集聚焦DNA 5'侧翼序列对CreA-ZFD结合能力的增强作用，核心发现为侧翼序列可使结合亲和力提升2.8倍。包含质粒构建、蛋白表达纯化、结合实验及结构模型等多类文件，为分子生物学相关研究提供支持。
文件详解
数据集包含16个文件，均位于“DNA flank enhances CreA-ZFD binding/”目录下，按类型分类说明如下：
- 质粒构建相关文件：
- 1 Plasmid construction-pGEX-6P-CreA-ZFD_double digest.jpg：JPG格式，质粒双酶切验证图片
- 1 Plasmid construction-pGEX-6P-CreA_double digest.jpg：JPG格式，质粒双酶切验证图片
- 1 Plasmid construction-pGEX-6P-CreA-ZFD_colony pcr.jpg：JPG格式，菌落PCR验证图片
- 1 Plasmid construction-CreA-ZFD PCR.jpg：JPG格式，CreA-ZFD片段PCR扩增图片
- 1 Plasmid construction-pGEX-6P-1-CreA-ZFD.dna：DNA格式，pGEX-6P-1-CreA-ZFD质粒序列文件
- 1 Plasmid construction-pGEX-6P-1-CreA-codon optimized.dna：DNA格式，密码子优化的CreA片段质粒序列文件
- 蛋白表达与纯化相关文件：
- 2 Expression and purification-GST-CreA-ZFD puriry-诺唯赞180kd plus.jpg：JPG格式，GST-CreA-ZFD蛋白纯度检测图片
- 2 Expression and purification-ZFD+PEI-SPFF.jpg：JPG格式，ZFD蛋白纯化色谱图
- 结合实验数据文件：
- 4 FP-ZFD+6-alcRC-1.2X-i3x.xlsx：XLSX格式，ZFD与alcRC序列结合的荧光偏振实验数据
- 4 FP-ZFD+Flank DNA-2X-i3x.xlsx：XLSX格式，ZFD与含侧翼DNA序列结合的荧光偏振实验数据
- 4 FP.pzfx：PZFX格式，荧光偏振实验原始数据文件
- 结构模型文件：
- 5 AlphaFold-CreA-ZFD_alcR_model.pdb：PDB格式，AlphaFold预测的CreA-ZFD与alcR结合的结构模型
- 5 AlphaFold-MIG1_SUC2_model.pdb：PDB格式，AlphaFold预测的MIG1与SUC2结合的结构模型
适用场景
- 分子生物学研究：分析DNA侧翼序列对蛋白-DNA结合的调控机制
- 蛋白工程应用：指导CreA-ZFD蛋白的优化与改造
- 结构生物学分析：基于AlphaFold模型研究蛋白-DNA复合物的相互作用模式
- 基因表达调控研究：探究侧翼序列在转录因子结合中的作用
