数据集概述
本数据集包含DNA电泳、qgPCR、桑格测序及Illumina GSA芯片分析的原始数据，覆盖基因分型、SNP测序、qgPCR结果等多类实验数据，为相关分子生物学实验的复现与分析提供支持。
文件详解
- 桑格测序数据文件：以.ab1格式为主（六十一文件），分布于不同克隆类型目录下，如Genotyping all clones/NHEJ-plasmid clones/P2G8_NHEJ-plasmid genotyping APP Swe locus.ab1，记录特定基因位点的测序信息
- Illumina GSA芯片数据文件：
- 芯片配置文件：如Fig. 3h microarray raw data/CHIP/MANIFEST/GSA-24v2-0_A1.bpm（.bpm格式）、GSA-24v2-0_A1_ClusterFile.egt（.egt格式）
- 芯片原始数据文件：如Fig. 3h microarray raw data/CHIP/DATA/203096860014/203096860014_R07C01_Grn.idat（.idat格式）
- 芯片结果文件：如Fig. 3h microarray raw data/CHIP/RESULTS/Weisheit_2020/Data/tabledat.bin（.bin格式）、Weisheit_2020 Exported Full Data Table.csv（.csv格式）
- qgPCR数据文件：如Fig. 3c+d qgPCR amplification plot/P1D22, P1C2, A18944 amplification plot TERT + qgPCR Assay 1.xls（.xls格式）
- 凝胶图像文件：Fig. 3b gel images/APPSwe PCR optimization gel image.pptx（.pptx格式）
数据来源
Weisheit et al. Nature Protocols 2020
适用场景
- 分子生物学实验复现：用于重复DNA电泳、qgPCR、桑格测序及芯片分析等实验流程
- 基因分型结果验证：分析不同克隆类型的基因位点信息
- 芯片数据二次分析：基于Illumina GSA芯片原始数据开展SNP相关研究
- 实验方法优化参考：通过qgPCR扩增曲线、凝胶图像等数据优化实验条件
