数据集概述
本数据集围绕濒危物种侏儒兔粪便DNA降解率评估展开，包含夏季野外条件下不同存放天数粪便样本的DNA质量检测结果，涉及线粒体DNA（mtDNA）和核DNA（nDNA）微卫星位点的PCR成功率、等位基因 dropout率等关键指标，用于验证非侵入性遗传采样方法对侏儒兔监测的有效性。
文件详解
- 补充信息表1数据集
- 文件名称：
Supp Info Table 1 dataset.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含275份已知个体粪便样本在1至60天野外存放后的DNA检测数据，可能涵盖样本年龄、DNA类型（mtDNA/nDNA）、位点长度、兔子性别、PCR成功率、等位基因dropout率、假等位基因率等核心指标
- 补充信息SAS代码文件
- 文件名称：
Supp info SAS code PCR ADO FA.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含用于分析PCR成功率、等位基因dropout（ADO）和假等位基因（FA）数据的SAS代码，涉及样本年龄对数转换、数据合并（bylocussuccess、pcrdata、notpcrdata数据集）、标记分类（如A2标记）等数据处理逻辑
数据来源
论文“Evaluating DNA degradation rates in faecal pellets of the endangered pygmy rabbit”
适用场景
- 野生动物非侵入性监测方法优化：分析粪便样本存放时间对DNA质量的影响，指导野外采样策略制定
- 濒危物种遗传监测技术研究：评估mtDNA与nDNA在不同条件下的降解差异，优化遗传标记选择
- 野生动物种群动态分析：为侏儒兔种群数量估算、个体识别、亲子关系分析提供数据支撑
- 气候变化对野生动物监测影响研究：探究环境温度对粪便DNA降解的作用机制，预测气候变化下的监测方法适应性
- 再引入种群遗传多样性监测：支持华盛顿中部侏儒兔再引入种群的遗传多样性长期监测
