DNA提取扩增测序数据集

数据集概述

本数据集为研究哈茨木霉DAA8和棘孢木霉LDA4协同增强皇竹草和东南景天在复合污染土壤中镉铬植物提取能力的相关实验数据,包含DNA提取、扩增及测序过程产生的微生物群落分析文件。

文件详解

该数据集包含8个文件,均位于“DNA extraction, amplification and sequencing/”目录下,具体说明如下: - 真菌ASV相关文件: - Fungus ASV.tre:TRE格式文件,可能为真菌ASV(扩增子序列变体)的系统发育树文件 - Fungus ASV.table.txt:TXT格式文件,包含真菌ASV的样本丰度数据,字段示例有ASV编号、T1R1-T8R3等样本列 - Fungus ASV.taxonomy_assignments.txt:TXT格式文件,真菌ASV的分类学注释结果文件 - Fungus ASV.table.xlsx:XLSX格式文件,真菌ASV丰度数据的Excel表格 - 细菌OTU相关文件: - bacteria otu.tre:TRE格式文件,可能为细菌OTU(操作分类单元)的系统发育树文件 - bacteria otu.table.xlsx:XLSX格式文件,细菌OTU丰度数据的Excel表格 - bacteria otu.taxonomy_7levels.xlsx:XLSX格式文件,细菌OTU在7个分类水平上的分类学注释结果 - Bacteria otu.taxonomy_assignments.xlsx:XLSX格式文件,细菌OTU的分类学注释结果文件

适用场景

  • 微生物生态学研究:分析复合污染土壤中接种木霉对植物根际真菌和细菌群落结构的影响
  • 植物修复机制研究:探究微生物群落与皇竹草、东南景天镉铬提取能力的关联
  • 环境微生物组分析:研究重金属污染土壤中微生物多样性及分类学特征
  • 生物修复技术优化:为利用木霉-植物联合体系修复重金属复合污染土壤提供微生物数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.8 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。