数据集概述
本数据集包含对喂食两种不同饮食的多样性远交(DO)小鼠群体进行的肝脏mRNA表达数量性状位点(eQTL)和miRNA表达数量性状位点(mirQTL)分析数据,揭示mRNA和miRNA在遗传调控模式(顺式或反式)、遗传力及饮食对遗传结构的影响等方面的差异,为理解临床性状和疾病易感性的遗传调控机制提供支持。
文件详解
- 核心数据文件(.rds格式)
- 文件名称:masterRes_3_12_20.rds、mirCross.rds、DO2_cross2.rds
- 文件格式:RDS
- 字段映射介绍:包含eQTL和mirQTL分析的关键结果数据,涉及mRNA与miRNA的遗传调控模式分类、遗传力计算、方差解释率统计及饮食对遗传结构影响的相关数据
- 数据字典文件
- 文件名称:DOeQTL_DataDictionary.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:对数据集相关术语、变量定义及数据结构进行说明,辅助理解eQTL和mirQTL分析中的字段含义
适用场景
- 遗传调控机制研究: 分析mRNA和miRNA表达的遗传调控模式(顺式/反式)差异及遗传力特征
- 饮食与基因表达关联分析: 探究饮食对肝脏eQTL和mirQTL遗传结构的影响机制
- 疾病易感性遗传基础研究: 识别与临床性状相关的候选基因及miRNA,解析疾病易感性的分子遗传机制
- 基因表达数量性状位点分析方法验证: 为eQTL和mirQTL分析方法提供数据支持与验证案例