数据集概述
本数据集包含海洋黄杆菌Dokdonia sp. MED134响应温度和光照变化的RNA-seq原始及处理数据,以及相关研究论文的补充文件,支持解析该菌株资源获取与碳固定通路的表达调控机制。
文件详解
- 数据文件(.xlsx格式,共6个):
- raw_counts.xlsx:原始基因表达计数数据
- transcripts_per_cell.xlsx:单位细胞转录本数数据
- normalized_DESeq2_values.xlsx:经DESeq2标准化的表达量数据
- Supp_Table1.xlsx:补充表格1,可能包含样本信息或实验设计
- Supp_Table2.xlsx:补充表格2,可能包含差异表达基因列表
- Supp_Table3.xlsx:补充表格3,可能包含功能富集分析结果
- 文档文件(.pdf格式,共1个):
- Gonzalez_et_al_suppl.pdf:研究论文的补充材料文档
适用场景
- 微生物分子生物学研究:分析温度对海洋异养菌基因表达的调控机制
- 环境微生物学研究:探究光照与温度耦合作用下微生物代谢通路的响应策略
- 转录组学数据分析:验证资源获取与碳固定相关基因的表达模式
- 海洋生态研究:解析海洋微生物适应环境温度变化的分子机制