Dr_辐射松与蓝桉遗传数据

数据集概述

本数据集包含辐射松(Pinus radiata)和蓝桉(Eucalyptus nitens)两个种群的系谱、表型和基因组数据,通过"ID"字段关联不同类型数据,支持植物遗传研究与育种分析,共6个文件。

文件详解

  • 辐射松表型数据文件:
  • 文件名称:Pinus_Penotypic_data.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含TreeID(树木编号)、IDnew(新个体标识)、IDbreed(育种标识)、ID(关联标识)、REP(重复组)、BLK(区块)、BR9、DBH、ST9、WD、PME等表型指标字段
  • 蓝桉SNP数据文件:
  • 文件名称:Eucalyptus_SNPdata.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含ID(个体标识)及SNP1至SNP25等基因型字段,基因型编码为-1、0、1(分别代表参考等位基因纯合子、杂合子、替代等位基因纯合子)
  • 辐射松系谱数据文件:
  • 文件名称:Pinus_Pedigree.csv
  • 文件格式:CSV
  • 辐射松SNP数据文件:
  • 文件名称:Pinus_SNPdata.csv
  • 文件格式:CSV
  • 蓝桉表型数据文件:
  • 文件名称:Eucalyptus_Phentypic_data.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 蓝桉亲缘关系矩阵文件:
  • 文件名称:Eucalyptus_Sib-ship_based_relationship_matrix.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含基于同胞关系重建的亲缘关系矩阵,行和列名为个体标识"ID"

数据来源

Dr.

适用场景

  • 植物遗传育种研究: 用于分析辐射松与蓝桉的遗传多样性、基因型与表型关联
  • 亲缘关系分析: 基于蓝桉同胞关系矩阵研究种群亲缘结构
  • 林业表型数据分析: 利用表型数据字段(如DBH、WD等)开展树木生长特性研究
  • 基因组选择辅助育种: 结合SNP数据与表型数据开发分子标记辅助育种模型
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 201.77 MiB
最后更新 2026年2月12日
创建于 2026年2月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。