数据集概述
本数据集包含果蝇线粒体基因组自然变异与感染保护相关性研究的原始数据及分析代码，涵盖感染后菌落形成单位、基因表达、线粒体拷贝数、呼吸代谢、活性氧水平、血细胞计数、寄生蜂感染应答等多维度实验数据，支持相关研究的结果验证与深入分析。
文件详解
- 数据文件（CSV/XLSX）
- 感染相关数据：Prettgeri_CFU.csv（雷氏普罗威登斯菌感染菌落数）、Saureus_CFU.csv（金黄色葡萄球菌感染菌落数）、Wasps_data.csv（寄生蜂幼虫黑化比例）、hc_inf.csv（感染后血细胞计数）
- 基因与表达数据：gene exp_mitotypes.csv（线粒体基因型相关基因表达）、copynumber.csv（线粒体拷贝数）、PPO3.csv（酚氧化酶原3表达）、mito_priming.csv（免疫 priming 效果）
- 生理指标数据：respirometry.csv（线粒体呼吸代谢）、ROS.csv（过氧化氢含量）、CellROX.csv（血细胞活性氧）、cybridMMP.csv（线粒体膜电位）、Combined.xlsx（感染后生存风险比）
- 血细胞数据：CC.csv（晶体细胞计数）、hc_uninf.csv（未感染血细胞计数）
- 分析代码文件（R/Rmd）
- 统计分析代码：CFU_stats.R、gene exp_mitotypes-stats.R、copynumber_stats.R、respirometry_stats.R、ROS_stats.R、wasp_stats.R、CC_stats.R、HC_stats.R、PPO3.R、MMP.R、CellROX.R、Mito_priming.R、hc_stats_supplementary.R、PI_hc_stats.R、melanisation_stats.R
- 风险比分析代码：Hazard.Rmd
数据来源
论文“A naturally occurring mitochondrial genome variant confers broad protection from infection in Drosophila”（doi:10.1101/2024.03.28.587162）
适用场景
- 线粒体基因组功能研究：分析线粒体变异对果蝇感染抵抗力的调控机制
- 昆虫免疫应答机制分析：探究血细胞、黑化反应、活性氧等免疫指标与感染保护的关联
- 基因表达调控研究：解析线粒体相关基因（如PPO3）在感染过程中的表达模式
- 生物医学数据复现：支持原始研究结果的验证与拓展分析
- 线粒体生理功能研究：研究线粒体呼吸、膜电位等指标与免疫保护的关系
