数据集概述
本数据集记录了基因型与环境互作对黑腹果蝇精浆蛋白质组构成的影响,通过液相色谱串联质谱分析12个等基因系在高低质量饮食下的全射精蛋白质组成,包含新发现的射精蛋白及其雄性生殖系统来源信息,以及饮食限制对蛋白活性和功能平衡的影响数据。
文件详解
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含数据集元数据说明,标注空值为NA,提及Table_S1_dataset包含Raw_dataset、Full_dataset、ComBat_dataset、Working_dataset、Extended_Working_dataset等工作表,涉及Fbgn_ID(果蝇基因库ID)及原始丰度等信息
- 文件名称:EJA.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Accession(登录号)、type(类型)字段,记录果蝇精浆相关蛋白的基因ID及类型(如SFPs)
- 文件名称:FRT.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Accession(登录号)字段,记录果蝇相关基因ID列表
- 文件名称:thorax_length.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:未提供具体字段预览,推测包含果蝇胸长相关测量数据
- 文件名称:bothContrasts.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:未提供具体字段预览,推测包含两组对比分析相关数据
- 文件名称:20220418_semenComposition_reference_list.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:未提供具体字段预览,推测包含精浆组成参考列表数据
- 文件名称:raw_MS_file_TMT_A-E.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:未提供具体字段预览,推测包含原始质谱TMT标记A-E组数据
- 文件名称:design.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:未提供具体字段预览,推测包含实验设计相关信息
数据来源
Valérian Zeender
适用场景
- 生殖生物学研究:分析果蝇精浆蛋白质组构成及基因型环境互作的影响机制
- 蛋白质组学分析:研究饮食限制对果蝇射精蛋白活性及功能平衡的调控作用
- 进化生物学研究:探索基因型与环境互作在果蝇生殖适应性进化中的作用
- 分子生物学实验:为果蝇雄性生殖系统蛋白功能验证提供数据参考
- 生物信息学分析:支持精浆蛋白质组相关基因ID及丰度数据的整合与挖掘