数据集概述
本数据集为果蝇亚属地理与生态多样化系统发育模式研究的相关数据，包含218个果蝇亚属主要物种群的系统发育树、校准文件、分析结果及图表文件，用于验证分类辐射是否对应进化辐射，探究地理扩散与生态资源转移对物种多样化速率的影响。
文件详解
- 系统发育分析文件
- 文件名称：partitioned_summary.tre、summary.tree、MCC_summary.tree
- 文件格式：TRE、TREE
- 字段映射介绍：包含果蝇亚属物种的系统发育树结构数据，记录物种间的进化关系及时序信息。
- 校准与分析配置文件
- 文件名称：alignment_analysis.xml、partitioned_2-3genes_all_calibrations.xml、partitioned_all_spp.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：系统发育分析的参数配置文件，包含基因序列比对、校准点设置及物种分组等分析逻辑。
- 可视化图表文件
- 文件名称：Fig4A.tif、Fig4B.tif、Fig5A.tif、Fig5B.tif
- 文件格式：TIF
- 字段映射介绍：研究结果的可视化图表，展示地理分布、生态资源利用与系统发育关系的关联模式。
数据来源
论文“Phylogenetic patterns of geographical and ecological diversification in the subgenus Drosophila”
适用场景
- 进化生物学研究：分析果蝇亚属物种的系统发育关系及时空分化模式。
- 生物地理学研究：探究果蝇亚属从亚洲热带向新热带区的扩散路径与地理分布格局。
- 生态适应研究：验证生态资源（如真菌、仙人掌）利用转变对物种多样化速率的影响。
- 分类学验证：检验果蝇亚属分类辐射是否对应实际的进化辐射过程。
- 系统发育方法应用：参考校准文件与分析配置，优化物种系统发育树的构建与时间估算流程。
