数据集概述
本数据集记录了果蝇亚隐翅虫(Drosophila subobscura)在实验室环境下30代适应性进化过程中,染色体排列、遗传含量及生活史性状的变化。包含3个重复种群的23种染色体排列动态、22个微卫星位点(倒位内外)的频率变化,以及连锁不平衡分析结果,用于探究倒位在适应性进化中的遗传机制。
文件详解
- 原始数据文件
- 文件名称:
Tracking changes in chromosomal arrangements_Rawdata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含果蝇亚隐翅虫实验室进化过程中,染色体排列频率、微卫星位点等位基因频率、连锁不平衡系数等原始观测数据,覆盖30代的动态变化记录。
- 数据分析代码文件
- 文件名称:
drift.source.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于分析遗传漂变对微卫星等位基因频率影响的R语言脚本,包含等位基因频率预期变化的计算逻辑,支持与实际观测频率的对比分析。
数据来源
论文“Tracking changes in chromosomal arrangements and their genetic content during adaptation”
适用场景
- 进化遗传学研究:分析染色体倒位在适应性进化中的作用及遗传含量的动态变化。
- 群体遗传学分析:探究实验室环境下果蝇种群染色体多态性的定向进化规律。
- 连锁不平衡研究:验证倒位与微卫星位点间的连锁关系及选择信号。
- 遗传漂变与选择的区分:通过模拟预期频率与实际观测的对比,解析适应性进化的驱动因素。