数据集概述
本数据集包含阿拉斯加66个粉鲑(Oncorhynchus keta)产卵种群的基因结构研究数据,通过90个核基因和3个线粒体单核苷酸多态性(SNP)分析,探究冰期动态环境下种群的距离隔离模式。数据反映了不同空间尺度和地理区域的基因分化差异,识别出9个偏离区域隔离模式的异常种群,为粉鲑种群遗传结构与地理因素的关系研究提供支持。
文件详解
- README文件:
- 文件名称:
README_for_Dryad data_July 25 2013.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明Excel工作簿的内容结构,包括基因型数据表的格式和字段定义(如种群编号、个体信息等)。
- 数据文件:
- 文件名称:
Dryad data_July 25 2013.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Genotypes数据表,采用GenALex标准格式,记录每个个体鱼的基因型数据。表头位于第3行,包含种群编号、个体信息等字段;单元格A1为研究使用的SNP数量,B1为总基因型个体数,C1-BQ1为每个种群的基因型个体数。
数据来源
Dryad数据平台(论文关联数据)
适用场景
- 种群遗传学研究:分析粉鲑种群的基因分化模式、距离隔离效应及空间尺度对遗传结构的影响。
- 冰期动态环境对物种的影响研究:探讨冰川历史和地理隔离对粉鲑种群基因流动的作用机制。
- 水产资源保护:识别异常种群,为粉鲑种群的保护策略制定和资源管理提供遗传数据支持。
- 基因标记应用:利用SNP标记数据开展粉鲑种群的遗传多样性评估和谱系分析。