数据集概述
本数据集围绕美国中西部草原优势草种大须芒草(Andropogon gerardii)的生态型遗传分化展开,通过AFLP基因分型技术分析11个草原种群的378株植物,探究环境梯度下的种群分化机制、适应性选择位点及气候关联。数据涵盖遗传多样性、地理距离、气候变量等多维度信息,为草原植物适应性研究提供支撑。
文件详解
- 文档类文件(TXT格式,共7个)
- 文件名称:README.txt、STRUCTURE_ECOTYPE.txt、BEDASSLE_Illustrativecode.R.txt、bayescan_input.txt、bayenv2_aflp_outliersrem.txt、bayenv2_aflp_allmarkers.txt
- 内容说明:包含数据说明文档、遗传结构分析输入文件、数据分析代码示例、选择位点检测输入及结果文件等
- 数据类文件(CSV/XLSX格式,共6个)
- 文件名称:pairwise_geographic_distances.csv、allele_counts.csv、weather.csv、aflp_raw_genotypes.csv、bayenv2_aflp_XtX.xlsx
- 内容说明:地理距离矩阵、等位基因计数表、采样点气象数据、AFLP原始基因型数据、环境关联分析结果表
- 压缩包文件(ZIP格式,共2个)
- 文件名称:BAYENV2_AFLPFILES.zip、BAYENV2_covariance_matrices.zip
- 内容说明:包含Bayenv2分析所需的AFLP数据文件及协方差矩阵文件
数据来源
Dryad数据库(关联论文:Ecotypes of an ecologically dominant prairie grass (Andropogon gerardii) exhibit genetic divergence across the U.S. Midwest grasslands environmental gradient)
适用场景
- 草原植物遗传生态学研究:分析大须芒草种群遗传结构、多样性及分化模式
- 环境适应性机制研究:探究隔离-by-环境(IBE)对生态型分化的影响,识别气候关联的选择位点
- 草原生态恢复应用:为草原修复中本地生态型的选用提供遗传依据
- 气候变化响应评估:预测优势草种对气候变化的适应潜力,支撑草原生态系统管理决策