数据集概述
本数据集围绕共生大肠杆菌功能基因型展开,探究其在宿主个体内和种群中的丰度关联。研究以54只成年山地帚尾袋貂为对象,分析34个基因定义的功能基因型与宿主内、种群丰度的关系,发现菌株在个体内相对丰度与种群丰度正相关,且两组丰度均与8个功能基因(agn43等)相关。
文件详解
- 文件名称:Data for DRYAD.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含54只山地帚尾袋貂宿主样本的大肠杆菌菌株数据,涉及34个功能基因的有无状态、菌株在宿主内的相对丰度、菌株在宿主种群中的丰度等核心字段,用于关联分析功能基因型与丰度的关系。
数据来源
论文“Functional genotypes are associated with commensal Escherichia coli strain abundance within host individuals and populations”
适用场景
- 微生物生态学研究: 分析共生大肠杆菌功能基因型在宿主个体及种群层面的丰度分布规律。
- 宿主-微生物互作机制探究: 研究宿主内菌株丰度与种群丰度的关联及功能基因的调控作用。
- 微生物基因型筛选: 识别与大肠杆菌丰度相关的关键功能基因(如agn43、focH等)。
- 野生动物微生物组研究: 以山地帚尾袋貂为模型,探索野生动物宿主共生微生物的生态特征。