数据集概述
本数据集聚焦地中海标志性针叶树（Pinus pinea L.），通过分析数百个基因位点的核苷酸多样性、分子适应性及遗传负荷模式，揭示其经历古老且长期种群崩溃后的遗传特征。数据包含基因注释、SNP计数、SSR原始数据及序列比对文件，支持种群遗传学与适应性进化研究。
文件详解
- README.txt
- 文件格式：TXT
- 内容介绍：数据集说明文档，关联论文DOI（10.5061/dryad.59zw3r23r），概述包含的三个核心文件（两个表格文件与一个压缩文件）
- Pinea_gene-annotations&SNPcounts.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含177个基因编码区域的名称、注释信息及可变位点原始计数
- Pinea_SSR_rawdata_def_2019.xls
- 文件格式：XLS
- 内容介绍：地中海松（Pinus pinea L.）的SSR（简单序列重复）标记原始数据
- Sequence-alignments.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容介绍：包含序列比对相关文件的压缩归档
数据来源
DRYAD数据库（关联论文：Evolutionary rate and genetic load in an emblematic Mediterranean tree following an ancient and prolonged population collapse，DOI:10.5061/dryad.59zw3r23r）
适用场景
- 植物种群遗传学研究：分析地中海松的核苷酸多样性、遗传负荷积累及种群历史动态
- 分子适应性进化分析：对比不同松属物种的适应性进化速率（α和ωa）差异
- 濒危物种保护策略制定：基于遗传 pauperization 特征，为地中海松的保护与管理提供数据支持
- 种群衰退遗传效应研究：探究长期种群崩溃对物种遗传多样性及进化潜力的影响机制
- 比较基因组学分析：与近缘物种（如 maritime pine）的遗传数据进行对比，解析不同种群历史对选择效率的作用
