Dryad_Based_Fst离群值检测方法性能评估数据

数据集概述

本数据集围绕Fst离群值检测方法的性能展开研究,评估了非平衡种群历史(如距离隔离、范围扩张)和中性参数化对四种常用方法(FDIST2、BayeScan、FLK、Bayenv2)的影响,分析了假阳性率、参数设置优化等核心问题,为群体遗传学中选择压力位点的准确识别提供参考。

文件详解

  • README_for_Dryad.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:数据集说明文档,包含.zip文件内容概述,说明其中R代码和函数用于景观遗传学模拟器,以及FDIST2方法的R实现源代码,注明代码为发表时原始版本。
  • Dryad.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包包含景观遗传学模拟器相关R代码、函数,以及用于种群历史模拟(中性或选择进化)的C函数实现代码,如Code_ALL_Select_C.R、Code_AllSourceFiles20130320等文件。

数据来源

Dryad数据平台

适用场景

  • 群体遗传学方法验证: 评估不同Fst离群值检测方法在非平衡种群历史下的准确性与鲁棒性。
  • 选择压力位点识别优化: 研究中性参数化对检测方法性能的影响,指导实际研究中参数设置。
  • 种群历史模拟工具开发: 利用提供的R和C代码,复现或扩展景观遗传学模拟器功能。
  • 假阳性率控制研究: 分析不同方法在距离隔离、范围扩张场景下的假阳性问题,为结果解读提供依据。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 170.73 MiB
最后更新 2026年2月7日
创建于 2026年2月7日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。