数据集概述
本数据集支持“光酶催化不对称氟代基团烯烃引入”研究,包含分子对接与聚类建模所需文件。通过黄素依赖烯还原酶的光诱导混杂性,实现含氟烷基碘生成碳中心自由基,与烯烃对映选择性反应,解决传统化学催化挑战,共含6个文件。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含研究背景、数据集用途说明,提及分子对接工具Autodock Vina及聚类建模相关内容
- 分子对接配置文件
- 文件名称:config.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:含受体文件(receptor)、配体文件(ligand)、对接中心坐标(center_x/center_y/center_z)、搜索空间大小(size_x/size_y/size_z)、输出文件(out)、CPU数量(cpu)、穷尽性参数(exhaustiveness)等字段
- 分子结构文件
- 文件名称:CHF2CH2I.pdbqt、3tx9.pdbqt、CHF2CH2I_out.pdbqt
- 文件格式:PDBQT
- 字段映射介绍:包含配体、受体及对接输出的分子结构信息,涉及空间坐标等gis_spatial相关语义
- 补充数据文件
- 文件名称:Supplementary_Data-Cartesian_coordinates.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:含笛卡尔坐标等补充数据内容
数据来源
Dryad(DOI: 10.5061/dryad.r2280gbm6)
适用场景
- 光酶催化不对称合成研究:分析氟代基团引入烯烃的对映选择性机制
- 分子对接模型验证:基于配置文件与结构文件验证光酶催化分子相互作用
- 氟代化合物生物合成策略优化:为含氟化学原料的酶法整合提供数据支持
- 酶催化反应机制分析:探究黄素依赖烯还原酶的光诱导混杂性及自由基生成过程