数据集概述
本数据集围绕铜绿假单胞菌的两种铁摄取系统展开,包含实验数据与模拟代码。实验聚焦该细菌在不同铁限制条件下,高效但代谢成本高的绿脓菌素与低效但成本低的脓菌素之间的表型切换现象,模拟验证了切换策略在波动铁环境中的竞争优势。
文件详解
- 实验数据文件
- 文件名称:
Dumas_etal_2013_ProcB_Dryad_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含铜绿假单胞菌在不同铁限制条件下(重度、中度),绿脓菌素与脓菌素单一生产菌株的生长数据,以及铁摄取机制切换相关的实验观测数据
- 模拟代码文件
- 文件名称:
Dumas_etal_2013_ProcB_Dryad_simulationcode.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:基于实验数据参数化的模拟代码,用于验证铁摄取机制切换策略在波动铁环境中的竞争优势
数据来源
Dryad平台(论文关联数据)
适用场景
- 微生物代谢策略研究:分析细菌在资源限制下的代谢成本与效率权衡机制
- 环境适应进化分析:探究波动环境中细菌表型切换策略的进化优势
- 微生物群体行为研究:验证铁摄取机制切换作为群体决策行为的反馈调控机制
- 实验数据模拟验证:利用R代码复现或扩展细菌铁摄取策略的竞争优势模拟