数据集概述
本数据集为环境协变局部适应遗传效应的元分析结果,包含反梯度和同梯度变异两种类型的遗传效应(VG)计算值,以及温度、配子大小等关键协变量的效应值。数据展示了野生种群中环境协变局部适应的普遍性及遗传效应强度,共含7个文件。
文件详解
- README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据背景、作者信息、GitHub仓库链接及使用指引
- Sparks_et_al._metadata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:元数据文件,记录研究相关的样本、实验设计及协变量信息
- mod_norm_logtrans_trait_2randeff_student_co_sp_allES_correct.rds
- 文件格式:RDS
- 字段映射介绍:同梯度变异遗传效应分析模型结果文件,存储贝叶斯元分析的模型参数及效应量
- mod_norm_logtrans_trait_2randeff_student_sp_allES.rds
- 文件格式:RDS
- 字段映射介绍:基础遗传效应分析模型结果文件,存储标准化处理后的性状遗传效应模型数据
- raw_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:原始数据文件,包含论文信息、性状类型、梯度类型、种群数量、梯度点、处理组、实验编号、种群环境、比较种群值及标准差等字段
- Supplemental_materials_v4reviewed_v1reviewed_final_clean.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:补充材料文档,含元分析方法细节、协变量筛选过程及结果验证内容
- mod_metareg_noyear_sp_wInt_allES_correct_parallel.RDS
- 文件格式:RDS
- 字段映射介绍:协变量元回归模型结果文件,存储去除年份效应后的协变量(温度、配子大小等)与遗传效应的回归分析数据
数据来源
Dryad数据平台(对应论文:Large genetic divergence underpins cryptic local adaptation across ecological and evolutionary gradients)
适用场景
- 进化生物学研究:分析野生种群中环境协变局部适应的遗传机制及效应强度
- 生态遗传学分析:探究温度、配子大小等协变量对遗传分化的影响
- 元分析方法应用:验证贝叶斯分层元分析在遗传效应评估中的适用性
- 适应性进化模型构建:为局部适应相关的进化模型提供实证数据支持
- 生物多样性保护:指导野生种群适应性管理策略的制定,考虑遗传分化的环境驱动因素