数据集概述
本数据集围绕高等白蚁肠道细菌群落结构展开,通过16S rRNA基因扩增子文库分析18种高等白蚁,探究饮食对其肠道细菌群落结构的影响。数据显示饮食是决定群落结构的主要因素,相同饮食组内同亚科白蚁肠道群落更相似,为微生物共生消化研究提供支撑。
文件详解
- 系统发育与分类数据文件
- 文件名称:Dryad_CoII.fasta、Dryad_CoII_tree.ntree
- 文件格式:FASTA、NTREE
- 字段映射介绍:包含CoII基因序列及对应的系统发育树数据,用于分析宿主或微生物的进化关系
- 微生物群落结构数据文件
- 文件名称:Dryad_OTUtable.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含OTUId(操作分类单元ID)及18种高等白蚁样本(如Microcerotermes_parvus、Nasutitermes_corniger等)的OTU丰度数据
- 群落差异分析文件
- 文件名称:Dryad_Community_dissimilarities.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含不同白蚁样本间肠道细菌群落的 dissimilarities(差异度)数据,用于比较群落结构差异
- 特定类群系统发育树文件
- 文件名称:Dryad_TG3_Fibrobacteres.tree、Dryad_Treponema_I.tree
- 文件格式:TREE
- 字段映射介绍:分别为Fibrobacteres门和Treponema属I类群的系统发育树数据,用于分析特定细菌类群的进化关系
数据来源
Dryad数据库(关联研究标题:Diet is the primary determinant of bacterial community structure in the guts of higher termites)
适用场景
- 微生物生态学研究: 分析高等白蚁肠道细菌群落结构的驱动因素,探究饮食与菌群的关联
- 共生消化机制研究: 研究白蚁与肠道细菌在木质纤维素消化中的共生关系
- 进化生物学分析: 利用系统发育树数据探究白蚁肠道细菌的进化历史及宿主特异性
- 环境微生物组研究: 对比不同饮食类型(木材、腐殖质、土壤有机质)白蚁的肠道菌群差异,为环境微生物组研究提供参考
- 生物信息学方法验证: 用于测试16S rRNA基因扩增子数据分析、OTU聚类及群落差异分析的生物信息学方法