数据集概述
本数据集为晚更新世永久冻土样本的扩增子焦磷酸测序研究数据，包含4种分子标记（12S rDNA、16S rDNA、cox1、trnL内含子）的测序结果，通过对照反应构建污染物库过滤样本序列，分析两土壤芯样本的分类组成重现性。数据支持古生物群落重建及污染物过滤方法验证，含10个相关文件。
文件详解
- 文档文件（.txt）
- 文件名称：README_for_Rscripts.txt、README_for_readidLineageMap.txt、README_for_perlScripts.txt、README_for_finalOTUseeds.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：各脚本及数据文件的说明文档，含使用方法、依赖说明及更新记录
- 压缩文件（.zip）
- 文件名称：perlScripts.zip、finalOTUseeds.zip、barcodePrimerFiles.zip、Rscripts.zip、readidLineageMap.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含Perl脚本、最终OTU种子序列、条形码引物文件、R脚本及序列谱系映射数据的压缩包
- 数据文件（.xlsx）
- 文件名称：DRYAD_dataflow.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：数据集的工作流说明文件，记录数据处理流程及步骤
数据来源
Dryad平台Porter et al. (2013)研究数据
适用场景
- 古生物群落重建: 分析永久冻土中古植物、动物及细菌群落组成，重建晚更新世生态环境
- 测序污染物过滤方法验证: 评估对照反应构建污染物库过滤样本序列的有效性
- 分子标记重现性分析: 比较不同分子标记（12S、16S、cox1、trnL）在土壤芯样本中的分类组成一致性
- 古生态对比研究: 结合植物大化石与测序数据，分析晚更新世白令东部与现代育空地区的植被差异
- 生物信息学方法应用: 利用提供的Perl/R脚本复现序列处理及分类单元分析流程
