数据集概述
本数据集为象海豹内皮细胞缺氧响应研究的配套数据，包含RNA-seq分析结果、基因列表及配置文件。通过对比象海豹与人类内皮细胞在缺氧条件下的分子差异，揭示象海豹抗氧化系统上调及血管生成信号解偶联的独特机制，为理解海洋哺乳动物缺氧耐受提供分子层面支持。
文件详解
- 文档类文件
- README.md（MD格式）：数据集说明文档，包含研究背景、数据来源及文件结构
- hs_genes_results.txt（TXT格式）：人类内皮细胞基因分析结果文件，含基因ID、转录本ID、长度、表达量（TPM/FPKM）等字段
- hs_genes.txt（TXT格式）：人类内皮细胞基因列表文件，记录参与分析的基因信息
- ma_genes.txt（TXT格式）：象海豹内皮细胞基因列表文件，记录参与分析的基因信息
- 配置类文件
- seal_compare_config.json（JSON格式）：含fn_gtf、timecourse等比较分析配置项
- seal_config.json（JSON格式）：含STAR_index、输入样本路径等测序分析配置项
- 结果类文件
- ma_genes_results.results（RESULTS格式）：象海豹内皮细胞基因分析结果文件
数据来源
Dryad数据库（DOI: 10.5061/dryad.7pvmcvf0p）
适用场景
- 海洋哺乳动物缺氧耐受机制研究：分析象海豹内皮细胞在缺氧条件下的分子响应特征
- 抗氧化系统调控机制研究：探究谷胱甘肽代谢相关基因上调对细胞缺氧保护的作用
- 血管生成信号通路研究：对比象海豹与人类细胞HIF-1α信号与血管生成解偶联的差异机制
- 细胞呼吸代谢研究：分析象海豹细胞缺氧后线粒体功能与糖酵解的变化关系
- 比较生理学研究：为极端环境适应的跨物种分子机制研究提供数据支持
