数据集概述
本数据集基于欧洲地松鼠(EGS)的多基因座系统地理学研究,包含线粒体DNA序列(细胞色素b基因)和12个核微卫星标记的分析数据,覆盖其现有自然分布区的915个样本。数据揭示了该物种的进化与古地理历史,支持潘诺尼亚和东南巴尔干草原作为更新世间冰期大陆气候的隐秘避难所,反映其冰期扩张/间冰期收缩的动态模式。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_Microsatellites genotypes for all individuals.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:描述Dryad平台存档数据的基本信息,关联研究论文,说明微卫星基因型数据的结构与内容。
- 微卫星基因型数据文件
- 文件名称:Microsatellites genotypes for all individuals.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含26列数据,首列"INDIVIDUAL CODE"为915个欧洲地松鼠个体的唯一编码,其余列对应12个核微卫星标记的基因型信息。
- 序列比对文件
- 文件名称:Dryad alignment.fas
- 文件格式:FAS(FASTA)
- 字段映射介绍:包含线粒体DNA(细胞色素b基因)的序列比对数据,用于系统发育与遗传多样性分析。
数据来源
Dryad数字仓储(关联研究论文:Multilocus phylogeography of the European ground squirrel: cryptic interglacial refugia of continental climate in Europe)
适用场景
- 种群遗传学研究:分析欧洲地松鼠的遗传结构、多样性及种群分化模式。
- 古生物地理学分析:探讨该物种冰期-间冰期的分布动态与避难所位置。
- 进化生物学研究:基于线粒体与核基因数据重建物种进化历史。
- 生物气候避难所验证:支持潘诺尼亚和东南巴尔干草原作为大陆气候隐秘避难所的假说。
- 保护遗传学应用:为欧洲地松鼠的保护策略制定提供遗传背景数据。