数据集概述
本数据集为美国西部悬钩子属（Rubus）本土与外来物种杂交种的繁殖方式研究数据，包含579个个体的基因型数据、遗传距离分析结果、繁殖方式分析代码及样本照片等，共38个文件，用于验证杂交种通过无融合生殖和有性重组产生后代的假设。
文件详解
- 文档文件（.txt，20个）
- 示例文件：
apomixis_genotypes_110218.txt、CBA6_genotypes.txt、README.txt
- 内容：包含样本基因型数据（含样本名、标记、等位基因、高度、大小等字段）、样本分组信息（如栽培品种分组）及数据集元数据说明
- 数据文件（.csv，11个）
- 示例文件：
CBA23_distances.csv、CBA28_distances.csv、species_chloroplast_latlong.csv
- 内容：包含样本间遗传距离矩阵、样本采集信息及叶绿体基因型数据
- 代码文件（.r，2个）
- 示例文件：
apomixis_analysis_111211.R、hybridization_analysis.R
- 内容：用于杂交分析和无融合生殖分析的R语言代码
- 归档文件（.zip，5个）
- 示例文件：
rubus_photos1.zip、rubus_photos3.zip
- 内容：悬钩子属样本的照片归档
数据来源
Dryad数据平台（论文“Spontaneous hybrids between native and exotic Rubus in the Western United States produce offspring both by apomixis and by sexual recombination”）
适用场景
- 植物遗传学研究：分析悬钩子属本土与外来物种的杂交模式及遗传结构
- 入侵物种繁殖机制研究：探究杂交种无融合生殖与有性重组结合的繁殖策略对入侵能力的影响
- 遗传距离分析：利用样本间遗传距离数据研究种群亲缘关系及进化路径
- 分子标记应用：验证微卫星和叶绿体标记在植物杂交检测中的有效性
- 进化生物学研究：模拟新入侵谱系形成的早期进化阶段，分析杂合性维持与适应性进化的关系
