数据集概述
本数据集为德国水牛(Bubalus bubalis)遗传多样性与群体结构研究的支撑数据,包含德国4个群体及保加利亚、罗马尼亚等欧洲国家共285份样本的基因分型数据,同时整合了巴西、印度等全球多地220份公开基因型数据,用于分析德国水牛的遗传背景及与全球群体的关系,共包含3个文件。
文件详解
- 文件名称:
README_file_Dryad_Frontiers2021.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,可能包含研究背景、数据采集方法、样本信息、分析流程及文件使用说明等内容
- 文件名称:
Noceoriginal.map
- 文件格式:MAP
- 字段映射介绍:SNP位点信息文件,通常包含SNP名称、染色体编号、遗传距离、物理位置等SNP标记的基本信息
- 文件名称:
Noceoriginal.ped
- 文件格式:PED
- 字段映射介绍:基因型数据文件,包含样本个体的家系信息、表型信息及每个SNP位点的基因型分型结果,是群体遗传分析的核心数据文件
数据来源
Dryad数据平台(关联论文:Genetic diversity of Bubalus bubalis in Germany and global relations of its genetic background)
适用场景
- 水牛群体遗传结构分析: 用于解析德国水牛群体的遗传组成、亚群划分及与欧洲、全球水牛群体的遗传关系
- 遗传多样性评估: 通过SNP数据计算遗传多样性指标,评估德国及欧洲水牛群体的遗传多样性水平与近交程度
- 品种起源与演化研究: 基于群体遗传距离构建系统发育树,探究欧洲水牛的起源及与其他地区水牛的演化关系
- 基因组选择信号分析: 利用ROH分析识别德国水牛群体中受选择的基因组区域,挖掘与适应性、生产性状相关的候选基因
- 水牛育种策略制定: 为德国及欧洲水牛的品种资源保护、遗传改良及可持续育种提供数据支撑