数据集概述
本数据集为夏威夷特有银剑植物群落(菊科)的系统发育与生物地理分析数据,包含核核糖体DNA(nrDNA)和叶绿体DNA(cpDNA)序列数据、系统发育树文件及说明文档,用于研究该类群的栖息地转移、岛间扩散、杂交事件及分支多样性,揭示其适应性辐射过程中的生态进化路径。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:README.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据背景、文件清单及使用说明
- DNA序列文件
- 文件名称:sword_cpDNA_indels_Dryad_copy.nex、sword_ETS_ITS_Dryad_copy.nex、sword_cpDNA_Dryad_copy.nex、sword_ETS_ITS.nex.IQcontree_copy.tre、sword_cpDNA_indels.nex.IQcontree_copy
- 文件格式:NEX、TRE
- 字段映射介绍:包含cpDNA和nrDNA(ETS/ITS)的序列数据及系统发育分析相关文件,记录植物样本的DNA序列信息
- 系统发育树文件
- 文件名称:cpDNA_recorded_indels_BI_MAP.tree、rDNA1_BI_MAP.tree
- 文件格式:TREE
- 字段映射介绍:基于cpDNA插入缺失数据和nrDNA数据构建的贝叶斯推断系统发育树,反映银剑植物群落的进化关系
数据来源
论文“Directionally biased habitat shifts and biogeographically informative cytonuclear discordance in the Hawaiian silversword alliance (Compositae)”
适用场景
- 植物系统发育研究: 分析夏威夷银剑植物群落的物种进化关系与分类地位
- 生物地理与扩散历史研究: 基于nrDNA和cpDNA数据推断岛间扩散路径,包括 Maui Nui 与 Hawai'i 之间的反向扩散事件
- 栖息地进化分析: 研究银剑植物从干旱祖先向湿润、沼泽等栖息地的适应性转移规律
- 细胞质核不一致性分析: 探讨叶绿体捕获等杂交事件对植物进化的影响
- 适应性辐射机制研究: 揭示该类群生态进化的限制路径与多样化模式