数据集概述
本数据集包含绿藻目Sphaeropleales的9个完整叶绿体基因组序列和4个片段化叶绿体基因组序列，以及基于56个基因数据集的系统发育分析相关材料，用于研究该类群的序列进化模式、基因组结构与内容特征，解决远古分化的系统发育关系问题。
文件详解
- 文件名称：README_for_Dryad.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据集包含的材料及用途，描述nexus文件夹内文件的内容（每个nexus文件对应一个蛋白编码基因的比对数据，含排除字符的掩码），指导用户复现论文中的分析。
- 文件名称：Dryad.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含nexus文件夹，文件夹中存有23个分类群叶绿体基因组的蛋白编码基因比对数据（每个基因对应一个nexus文件，含序列比对结果和分析用掩码）。
数据来源
Dryad数据平台（对应论文“Chloroplast phylogenomic data from the green algal order Sphaeropleales (Chlorophyceae, Chlorophyta) reveal complex patterns of sequence evolution”）
适用场景
- 绿藻系统发育研究：利用叶绿体基因组序列数据推断Sphaeropleales目及相关类群的进化关系，解决远古分化节点的系统发育问题。
- 叶绿体基因组进化分析：分析叶绿体基因组的结构、内容特征及序列进化模式，比较核苷酸与氨基酸水平分析的差异。
- 多基因数据集分析方法验证：探索大型多基因数据集的系统发育分析策略，研究系统偏差和信号冲突的解决方案。
- 藻类进化生物学研究：为绿藻门（Chlorophyta）叶绿体基因组的进化规律提供数据支持，辅助相关领域的文献综述与元分析。
