数据集概述
本数据集来自Dryad数据平台,围绕植物源环境DNA(eDNA)与传统节肢动物监测方法的对比研究展开。通过四项实验,测试了植物表面冲洗液和均质植物材料的eDNA宏条形码技术,与传统监测方法在节肢动物群落多样性及植物-节肢动物互作检测上的性能差异。数据集包含385个文件,支持生物多样性监测技术的有效性验证与互作关系分析。
文件详解
- 原始测序数据文件(.fastq.gz)
- 文件名称:遵循编号与样本标识命名模式,如IndexPCRBlank_S17_L001_R2_001.fastq.gz、S35_S191_L001_R1_001.fastq.gz
- 文件格式:GZ压缩的FASTQ
- 字段映射介绍:包含Illumina测序产生的原始读段数据,记录节肢动物的eDNA序列信息,用于后续生物信息学分析
- 元数据文件(.xlsx)
- 文件名称:Trier_data_raw_raff_tax_meta.xlsx、Kimmlingen_data_raw_raff_tax_meta.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含样本的原始数据、分类学信息及元数据,支持群落多样性统计与互作关系分析
- 说明文档(.md)
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含数据集的来源、关联论文信息及数据使用说明,关联DOI为https://doi.org/10.5061/dryad.79cnp5j2c
数据来源
Dryad数据平台(DOI: 10.5061/dryad.79cnp5j2c)
适用场景
- 生物多样性监测技术对比研究:用于分析植物源eDNA与传统监测方法在节肢动物群落多样性(α、β多样性)评估上的一致性与互补性
- 植物-节肢动物互作关系检测:利用eDNA数据挖掘植物与节肢动物的物种特异性互作,尤其是专食性 herbivores的互作关系
- 环境DNA技术应用验证:测试植物表面冲洗液与均质植物材料的eDNA宏条形码技术在生物多样性监测中的准确性与有效性
- 群落生态学研究:通过eDNA数据解析个体植物及植物不同部位的节肢动物群落细微分化特征