数据集概述
本数据集围绕红大马哈鱼(Oncorhynchus nerka)和银大马哈鱼(O. kisutch)的SNP标记开发展开,包含54个新SNP检测方法的开发数据,以及用于区分哥伦比亚河流域种群的SNP评估结果,涉及引物设计、测序筛选、基因型验证及种群遗传分析等内容。
文件详解
- Dryad-data.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:包含SNP标记开发与种群评估的核心数据,可能涉及引物信息、SNP位点筛选结果、基因型验证数据、哥伦比亚河流域种群基因型数据及种群遗传分析结果等字段
- Fasta aligned.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含SNP筛选过程中产生的多序列比对文件,用于展示红大马哈鱼与银大马哈鱼DNA序列的比对结果,支持SNP位点的识别与验证
数据来源
Dryad数据平台(对应论文:Development of 54 novel SNP assays for sockeye and coho salmon and assessment of available SNPs to differentiate stocks within the Columbia River)
适用场景
- 鲑鱼SNP标记开发研究:用于分析红大马哈鱼与银大马哈鱼SNP标记的开发流程、筛选标准及验证方法
- 种群遗传学分析:评估SNP标记在区分哥伦比亚河流域红大马哈鱼与银大马哈鱼种群中的应用价值
- 分子标记辅助育种:为鲑鱼的分子标记辅助育种提供可靠的SNP标记资源
- 渔业资源保护:通过种群遗传分析结果,为哥伦比亚河流域鲑鱼种群的保护与管理提供科学依据