数据集概述
本数据集为加勒比深度广适性珊瑚Montastraea cavernosa的垂直连通性研究数据,包含583个珊瑚样本的基因分型、共生藻分型及分析输入文件,覆盖佛罗里达群岛、百慕大等区域的浅/中/深三个深度带,用于验证深礁避难所假说,探究地理与深度对珊瑚基因连通性的影响。
文件详解
- 说明文档类(TXT格式)
README_for_Serrano et al_Symbiodinium typing.txt:共生藻分型数据说明,含样本ID、地理位置、深度等字段解释
README_for_Serrano et al_DRYAD_Mcav genotypes.txt:珊瑚基因型数据说明
Serrano et al_mainparams Structure.txt:Structure软件主参数配置文件
parmfile.txt:分析参数配置文件
infile.txt:基因分析输入文件
Serrano et al_Structure input.txt:Structure软件输入文件,含9个微卫星位点的基因型数据(如Locus_4_1、Locus_18_1等)
- 数据文件类(XLSX格式)
Serrano et al_DRYAD_Mcav genotypes.xlsx:珊瑚样本基因型数据表
Serrano et al_Symbiodinium typing.xlsx:共生藻(Symbiodinium spp.)分型数据表
数据来源
DRYAD(关联论文:Geographic differences in vertical connectivity in the Caribbean coral Montastraea cavernosa despite high levels of horizontal connectivity at shallow depths)
适用场景
- 珊瑚礁生态连通性研究:分析不同地理区域及深度带珊瑚的基因交流模式
- 深礁避难所假说验证:评估深礁对浅礁珊瑚恢复的潜在贡献
- 共生藻与珊瑚适应性研究:探究Symbiodinium spp.的深度分布与珊瑚连通性的关联
- 海洋保护策略制定:为加勒比珊瑚礁保护区的深度梯度设计提供数据支持
- 珊瑚基因分型技术应用:作为微卫星标记在珊瑚种群遗传学研究中的实例数据