数据集概述
本数据集为论文《Jack-of-all-trades is parthenogenetic》的电子附录,聚焦甲螨(Oribatida)生殖模式与生态策略的关系研究。通过分析甲螨地理分布范围等数据,验证冰冻生态位变异假说与通用基因型假说,结果支持孤雌生殖甲螨为广适性“多面手”。数据集包含11个相关文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README_file_Jack_of_all_trades.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含标题、作者信息等基础内容
- 附录表格文件
- 文件名称:006_APPENDIX_table_1_the_geographic_regions_NEW.xlsx、007_APPENDIX_table_2_the_taxa_and_their_reproductive_modes_NEW.xlsx、008_APPENDIX_table_3_NCBI_data_NEW.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:分别记录地理区域划分、甲螨类群及其生殖模式、NCBI相关数据等附录信息
- 分析脚本与数据文件
- 文件名称:R_script_species-names.csv、R_script_nodesupport_01.csv、R_script_droptaxa_list_06.csv、R_script_DataMark_AreaFamily_06.csv、violin_plot_data.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含物种名称、节点支持度、分类单元筛选列表、区域科属标记数据、小提琴图数据等分析用数据
- 其他分析文件
- 文件名称:R_script_ff_06_rev_new_version.Rmd、R_script_ForFun_18S_all_03.fasta
- 文件格式:Rmd、FASTA
- 字段映射介绍:R分析脚本、18S基因序列数据
数据来源
DRYAD平台论文《Jack-of-all-trades is parthenogenetic》电子附录
适用场景
- 进化生态学研究:分析孤雌生殖与有性生殖甲螨的生态策略差异,验证相关进化假说
- 生物地理学分析:利用地理分布数据研究甲螨物种的地理分布范围与生殖模式的关系
- 分子系统学研究:基于基因序列数据开展甲螨类群的系统发育分析
- 生态位分化研究:探索甲螨物种生态位宽度与生殖模式的关联机制