数据集概述
本数据集包含糖松（Pinus lambertiana）的高密度连锁图谱数据，用于辅助构建该物种染色体级参考基因组（组装版本2.0，未发表）。糖松是北美西部具有重要经济和生态价值的五针松，因基因组达31 Gb（植物二倍体物种中最大之一），组装难度大。数据集含2个连锁图谱Excel文件及1个说明文档，总计3个文件。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：包含数据集内容摘要、实验背景说明，提及连锁图谱的用途、距离单位（厘摩cM）、连锁群命名规则（L1-L12，BC1与BC2群体连锁群ID不匹配）等关键信息。
- 连锁图谱数据文件（BC2群体）
- 文件名称：SP_mapping_results_BC2_4111SNPs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含BC2群体的糖松连锁图谱数据，含4111个SNP标记，记录连锁群、标记位置（厘摩cM）等信息。
- 连锁图谱数据文件（BC1群体）
- 文件名称：SP_mapping_results_BC1_3656SNPs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含BC1群体的糖松连锁图谱数据，含3656个SNP标记，记录连锁群、标记位置（厘摩cM）等信息。
数据来源
Dryad（DOI: 10.5061/dryad.573n5tbdz）
适用场景
- 糖松染色体级基因组组装辅助：利用连锁图谱数据对糖松基因组scaffold进行染色体水平挂载。
- 糖松遗传标记分析：研究BC1和BC2群体中SNP标记的分布与连锁关系。
- 林木基因组学研究：为五针松属物种的基因组结构解析提供参考数据。
- 经济林木遗传育种：辅助糖松重要经济性状的QTL定位与分子标记开发。
