数据集概述
本数据集是Rose等(2018)发表于《Molecular Phylogenetics and Evolution》的相关研究数据,包含杜鹃花目被子植物系统发育分析、BioGeoBEARS生物地理学分析和BAMM多样化分析的输入文件,为研究杜鹃花目演化关系及地理分布提供支持。
文件详解
数据集包含4个目录共10个文件,具体说明如下:
- BAMM目录(多样化分析文件):
- control_Ericales.txt: TXT格式,BAMM分析控制文件
- Ericales.config: CONFIG格式,BAMM分析配置文件
- fraction_Ericales.txt: TXT格式,BAMM分析比例参数文件
- Ericales_BAMM.tre: TRE格式,BAMM分析系统发育树文件
- BioGeoBEARS目录(生物地理学分析文件):
- Ericales_5area_manual_dispersals.txt: TXT格式,5区域手动扩散参数文件
- Ericales_BioGeoBEARS_tip_states.txt: TXT格式,末端分类单元状态文件
- Ericales_timeperiods.txt: TXT格式,时间区间参数文件
- phylogeny目录(系统发育分析文件):
- Ericales_alignment_loci.txt: TXT格式,序列比对位点信息文件
- Ericales_partitions.txt: TXT格式,数据分区信息文件
- Ericales_sumpermatrix.fasta: FASTA格式,合并序列矩阵文件
适用场景
- 植物系统发育研究: 分析杜鹃花目被子植物的演化关系及分类地位
- 生物地理学分析: 探究杜鹃花目植物的历史地理分布及扩散路径
- 物种多样化研究: 揭示杜鹃花目植物的物种形成速率及驱动因素
- 演化生物学教学: 作为分子系统学与生物地理学分析的案例数据
- 植物区系关联研究: 验证新热带区与东亚植物区系的古老联系假说