多基因座物种界定方法数据集

数据集概述

本数据集包含一种基于贝叶斯模型比较和有根三元组的快速可扩展多基因座物种界定方法相关数据,涵盖模拟数据、实证数据(如芽孢杆菌属序列数据)及补充文档,支持该方法的性能评估与应用验证。

文件详解

  • 系统发育树文件:
  • bacillus.clonalframe.consensus.tre: TRE格式,芽孢杆菌属的共识系统发育树文件
  • bacillus.7hk.MCC.tre: TRE格式,芽孢杆菌属的多树合并(MCC)系统发育树文件
  • 压缩数据文件:
  • sim10sp.40loci.simulationC.zip: ZIP格式,10个物种40个基因座的模拟数据集C
  • bacillus.alignments.zip: ZIP格式,芽孢杆菌属的序列比对数据压缩包
  • sim10sp.40loci.zip: ZIP格式,10个物种40个基因座的模拟数据集
  • sim3sp_25loci.zip: ZIP格式,3个物种25个基因座的模拟数据集
  • 补充文档:
  • SupplementaryFigures.pdf: PDF格式,补充图表文件
  • SupplementaryTextS1_rev160202.docx: DOCX格式,修订版补充文本S1(160202版本)

适用场景

  • 计算生物学研究: 验证多基因座物种界定方法的性能与准确性
  • 系统发育分析: 基于模拟或实证数据开展物种边界划分研究
  • 微生物分类学: 应用于芽孢杆菌属等类群的物种界定实践
  • 生物信息学方法开发: 为物种界定算法优化提供数据支撑
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 23.83 MiB
最后更新 2025年12月11日
创建于 2025年12月11日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。