数据集概述
本数据集为研究抗逆内共生甲藻Durusdinium对高度城市化珊瑚礁系统中鹿角杯形珊瑚(Pocillopora acuta)存活贡献的配套在线资源,包含4个文件,涉及Symbiodineaceae序列的BLAST结果、差异表达转录本(DETs)及差异表达基因(DEGs)的分析摘要,支持珊瑚共生关系与环境适应性研究。
文件详解
- Online Resource 1 cp23S BLAST.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:Symbiodineaceae科cp23S序列的BLAST比对结果数据
- Online Resource 2 ITS2 BLAST.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:Symbiodineaceae科ITS2序列的BLAST比对结果数据
- Online Resource 3.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:EDGE分析摘要,包含不同基因型和处理组的差异表达转录本(DETs)、对应倍数变化值、错误发现率(FDR)及蛋白质匹配信息
- Online Resource 4.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:不同基因型和处理组的差异表达基因(DEGs)摘要及对应倍数变化值
数据来源
论文“The contribution of stress-tolerant endosymbiotic dinoflagellate Durusdinium to Pocillopora acuta survival in a highly urbanized reef system”
适用场景
- 珊瑚共生甲藻分子鉴定: 利用cp23S和ITS2序列的BLAST结果,分析Symbiodineaceae科内共生甲藻的种类组成与遗传特征
- 珊瑚抗逆分子机制研究: 通过DETs和DEGs的分析数据,探究Durusdinium增强Pocillopora acuta环境适应性的基因表达调控机制
- 城市化珊瑚礁生态适应性分析: 结合差异表达数据,评估高度城市化环境中珊瑚-甲藻共生关系对珊瑚存活的贡献
- 海洋生态保护策略制定: 基于共生甲藻的抗逆性研究结果,为受人类活动影响的珊瑚礁生态系统保护提供科学依据