数据集概述
本数据集包含用于DysRegnetPackage的模型测试数据,涉及肺和乳腺组织的基因调控关系分析。包含2个压缩模型文件和2个过滤后的基因表达数据CSV文件,记录调控基因、靶基因及其权重关系,支持基因调控网络相关的模型测试与分析。
文件详解
- 压缩模型文件(archive_files)
- 文件名称:lung_models.zip、breast_models.zip
- 文件格式:.zip
- 内容说明:分别对应肺组织和乳腺组织的模型文件压缩包
- 基因调控数据文件(data_files)
- 文件名称:linkedList_output_slurm_gene_tpm_v10_lung_filtered.csv、linkedList_output_slurm_gene_tpm_v10_breast_mammary_tissu_filtered.csv
- 文件格式:.csv
- 字段映射介绍:包含regulatoryGene(调控基因)、targetGene(靶基因)、weight(权重)三个字段,记录基因间的调控关系及权重值
适用场景
- 基因调控网络研究:分析肺和乳腺组织中调控基因与靶基因的关联关系及权重分布
- 生物信息学模型测试:用于DysRegnetPackage相关模型的验证与性能评估
- 癌症相关基因分析:探索肺、乳腺组织中关键调控基因的作用机制
- 基因表达数据挖掘:基于过滤后的基因TPM数据开展差异表达及调控模式研究