数据集概述
本数据集记录东亚得里亚海绵羊X染色体的选择信号识别结果,包含8个克罗地亚本地绵羊品种(101只雌性、100只雄性)及10只摩弗伦羊的基因组数据,通过经典方法与新方法HRiD识别出14个选择信号及34个注释基因,为研究绵羊X染色体适应性基因提供支持。
文件详解
- README_Overall.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据、基因分型及质量控制的总体说明,涵盖采样背景、样本信息、DNA提取方法等基础信息。
- README_for_EastAdriaticSheep_and_mouflons.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:针对东亚得里亚海绵羊及摩弗伦羊样本的详细说明文档,可能包含样本分组、实验设计等补充信息。
- EastAdriaticSheep_chrX.ped
- 文件格式:PED
- 字段映射介绍:绵羊X染色体基因型数据文件,记录样本个体的基因型信息,用于选择信号分析的核心数据来源。
- EastAdriaticSheep_chrX.map
- 文件格式:MAP
- 字段映射介绍:绵羊X染色体遗传图谱文件,包含SNP位点的染色体位置、物理位置等信息,与PED文件配合使用。
数据来源
论文“Identification of selection signals on the X-chromosome in East Adriatic sheep: a new complementary approach”
适用场景
- 绵羊X染色体适应性基因研究: 分析X染色体上的选择信号,识别与环境适应相关的功能基因。
- 畜牧基因组选择信号分析: 验证经典选择信号检测方法与新方法HRiD的应用效果,优化基因组选择技术。
- 地方绵羊品种遗传多样性评估: 基于X染色体基因型数据,研究克罗地亚本地绵羊品种的遗传结构与多样性。
- 基因组育种应用: 为仅雄性基因型数据的育种值估计场景提供HRiD方法的实践参考。