数据集概述
本数据集围绕海洋表层细菌群落的系统发育距离与生态系统生产力的关联展开,包含5个相关文件,涉及细菌系统发育树、OTU表、系统发育距离矩阵、环境数据及序列比对结果,用于验证活性微生物群落的进化历史对生态系统功能的影响,为海洋生态学研究提供基础数据支持。
文件详解
- Tree.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:存储细菌群落的系统发育树信息,反映群落内物种的进化关系与分支结构
- OTU_table.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含操作分类单元(OTU)的丰度数据,记录不同OTU在样本中的相对或绝对数量
- Phylogenetic_distance_matrix.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:存储细菌群落内物种间的系统发育距离矩阵,量化物种进化关系的远近程度
- Environmental data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录海洋表层环境参数数据,可能包括温度、盐度、营养盐等影响细菌群落的环境因子
- Alignment.fa
- 文件格式:FA
- 字段映射介绍:存储细菌基因序列的比对结果,为系统发育分析提供序列基础
数据来源
论文“Ecosystem productivity is associated to bacterial phylogenetic distance in surface marine waters”
适用场景
- 海洋微生物生态学研究:分析海洋表层细菌群落的系统发育多样性与生态系统生产力的关联机制
- 微生物多样性功能研究:验证活性细菌群落的进化历史对生态系统功能的预测作用
- 环境因子与微生物互作分析:结合环境数据探讨环境参数对细菌系统发育距离及生产力的影响
- 微生物群落结构分析:利用系统发育树、OTU表等数据解析海洋表层细菌群落的组成与结构特征