数据集概述
本数据集为拉贾安帕特海域鱼类多样性研究成果，通过eDNA宏条形码技术结合采样理论方法，补充传统目视调查未发现的物种，更新区域海洋鱼类名录，并估算潜在未记录物种数量，为生物多样性保护策略提供数据支持。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：Appendix_S1_Laboratory_and_bioinformatic_analyses.docx、README.docx、Appendix_S2_Reference_database_completion.docx
- 文件格式：docx
- 字段映射介绍：包含实验室及生物信息学分析方法、数据说明文档、参考数据库完成度说明等研究背景与方法细节
- 数据库类文件
- 文件名称：OTU_ecotag_custom_ref_database.csv、Appendix_S3_Custom_reference_database_12S_Lengguru.csv、OTU_ecotag_ncbi.csv
- 文件格式：csv
- 字段映射介绍：包含OTU与自定义参考数据库、NCBI数据库的匹配信息，如物种分类单元、匹配度、分类层级（科、属、目）等
- 物种名录类文件
- 文件名称：Appendix_S4_Updated_marine_fish_checklist_of_the_Raja_Ampat_Birds_Head_Peninsula_region.xlsx、Appendix_S4_Updated_marine_fish_checklist_of_the_Raja_Ampat_Birds_Head_Peninsula_region_2.xlsx
- 文件格式：xlsx
- 字段映射介绍：更新后的拉贾安帕特海域海洋鱼类名录，包含确认存在及高概率存在的物种信息
- 物种检测结果类文件
- 文件名称：Appendix_S6_list_of_species_detected_by_eDNA.csv、Appendix_S5_List_of_species_detected_by_UVC.csv
- 文件格式：csv
- 字段映射介绍：分别记录eDNA检测到的物种（含序列数、PCR次数等）和水下目视调查（UVC）检测到的物种信息
- 其他数据文件
- 文件名称：OTU_occurrences.table
- 文件格式：table
- 字段映射介绍：OTU出现频次表，记录各操作分类单元的分布情况
数据来源
论文“Estimating the extended and hidden species diversity from environmental DNA in hyper-diverse regions”
适用场景
- 海洋生物多样性评估: 分析拉贾安帕特海域鱼类物种组成、分布及潜在未记录物种
- 保护生物学研究: 基于扩展的物种名录优化区域生物多样性保护策略
- 环境DNA技术应用: 验证eDNA宏条形码技术在补充传统生物调查中的有效性
- 生物信息学分析: 研究OTU与参考数据库的匹配方法及物种分类准确性
- 海洋生态监测: 为长期监测区域鱼类多样性变化提供基准数据
