数据集概述
本数据集为热带海洋环境中基于eDNA的生物多样性监测研究数据,通过“生命树”(ToL)元条形码技术,检测到真核生物287个科,涵盖主要类群。数据对比了 shotgun测序与元条形码方法的效率差异,展示多PCR检测组合对生物多样性编目的必要性,支持鱼类属内种间单倍型分析,共包含10个文件。
文件详解
- 文件名称:18S V4.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:基于18S V4区域的元条形码测序数据压缩包
- 文件名称:Sym 23S.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:基于Sym 23S区域的元条形码测序数据压缩包
- 文件名称:Mam 16S.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:基于Mam 16S区域的元条形码测序数据压缩包
- 文件名称:Crust 16S.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:基于Crust 16S区域的元条形码测序数据压缩包
- 文件名称:Ceph 16S.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:基于Ceph 16S区域的元条形码测序数据压缩包
- 文件名称:trnL.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:基于trnL区域的元条形码测序数据压缩包
- 文件名称:Prokaryote 16S.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:基于Prokaryote 16S区域的元条形码测序数据压缩包
- 文件名称:Fish 16S.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:基于Fish 16S区域的元条形码测序数据压缩包
- 其他文件:2个未具体命名的ZIP格式元条形码测序数据压缩包
数据来源
论文“Ecosystem biomonitoring with eDNA: metabarcoding across the tree of life in a tropical marine environment”
适用场景
- 热带海洋生物多样性监测: 利用eDNA元条形码数据评估热带海洋生态系统中真核生物的多样性组成与分布
- 海洋eDNA技术方法优化: 对比不同测序策略(shotgun vs 元条形码)及PCR检测组合的生物多样性检测效率
- 海洋生物分类学研究: 通过多区域元条形码数据解析热带海洋生物的分类学信息,包括鱼类属内种间单倍型分析
- 海洋生态管理决策支持: 为热带海洋保护区的生物多样性评估与管理提供数据支撑
- 海洋环境监测技术应用: 推动eDNA metabarcoding技术在常规海洋生物监测项目中的整合应用