数据集概述
本数据集围绕环境DNA(eDNA)估算物种丰富度的研究展开,包含通过电捕鱼法与eDNA宏条形码技术检测的印第安纳州北部溪流鱼类群落数据,对比两种方法的物种检测结果,验证eDNA在生态系统物种识别中的应用价值,共含11个文件。
文件详解
- 补充表格文件(共7个)
- 文件名称:Supplement Table 1.xlsx、Supplement Table 2.xlsx、Supplement Table 4.xlsx、Supplement Table 5.xlsx、Supplement Table 6.xlsx、Supplement Table 7.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含两种采样方法的物种检测结果、Chao II估算值、置信区间等实验数据及统计结果
- 序列文件(共4个)
- 文件名称:Actino16s.OTU.ID.hmm.fasta、Amphibia12s.OTU.ID.hmm.fasta、Cytb.OTU.ID.hmm.fasta、Actino12s.OTU.ID.hmm.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含不同基因标记(16s、12s、Cytb)的操作分类单元(OTU)序列数据,用于物种识别与分类
数据来源
论文“Estimating species richness using environmental DNA”
适用场景
- 水生生物多样性监测: 对比电捕鱼与eDNA技术的物种检测效率,优化溪流鱼类群落调查方法
- 环境DNA技术验证: 评估eDNA宏条形码技术在物种丰富度估算中的准确性与应用潜力
- 生态系统管理: 为自然系统生物多样性有效管理提供物种存在数据支持
- 分子生态学研究: 利用不同基因标记的FASTA序列数据,分析水生生物的物种组成与分布特征